История так называемого юрского сепаратизма началась в XIV веке, когда франкоязычная область в горном массиве Юра была присоединена к немецкоязычному кантону Берн в ходе так называемых Бургундских войн. В XVI веке в Швейцарии началась Реформация, и немецкоязычное население Берна начало переходить в протестантство. Франкоязычное католическое население Юры восприняло это негативно, что усугубило внутренний конфликт.
В период наполеоновских войн регион Юра входил в состав Гельветической республики как часть княжества-епископства Базель. Однако после поражения Наполеона представители России, Великобритании, Австрии, Пруссии, Франции, Португалии, Швеции и Испании встретились на конгрессе в Вене для того, чтобы определить новые границы европейских государств и восстановить разрушенные французской революцией и наполеоновскими войнами монархии.
По итогам Венского конгресса 1814–1815 гг. Юра был снова присоединен к кантону Берн, чтобы компенсировать отделение от него кантона Во. В 1947 году был сформирован так называемый комитет Мутье, который требовал для региона широкой автономии, а к 1949 году в Юре оформилось полноценное сепаратистское движение, требовавшие для кантона независимости.
Однако вплоть до 1960-х годов культурные и политические конфликты между франко- и немецкоязычным населением Берна носили в основном бытовой характер. Активизация военного крыла сепаратистской организации «Ассамблея Юры» началась в 1960-е годы с мелких провокаций и акций протеста. Во многом ее участники вдохновлялись национально-освободительными движениями в африканских и азиатских колониях. В 1967 году властям кантона пришлось вмешаться и сформировать официальную комиссию для решения конфликта.
23 июня 1974 года в кантоне был проведен референдум за отделение от кантона Берн. Более половины проголосовавших поддержали идею создания отдельного кантона, но разница между проголосовавшими «за» и «против» была незначительной. 16 марта 1975 года провели второй референдум, по итогом которого округи Делемон, Поррентрю и Франш-Монтань выбрали отделение от Берна, а округи Куртелари, Ла-Нёвилль, Мутье и Лауфен предпочли остаться в его составе.
В 1977 году была ратифицирована конституция будущего кантона, в 1978 году жители Швейцарии на общенациональном референдуме проголосовали за то, чтобы принять кантон Юра в состав Швейцарской конфедерации, а 1 января 1979 года Юра официально стал полноценным членом конфедерации.
23 июня в кантоне Юра официально отмечают День независимости. Для жителей кантона это нерабочий праздничный день. Аналогичные праздники существуют и в некоторых других кантонах: к примеру, Невшатель 1 марта отмечает годовщину провозглашения республики, кантон Гларус в первый четверг апреля празднует годовщину битвы при Нефельсе, а в Женеве в начале сентября (в четверг, следующий за первым воскресеньем месяца) отмечается Женевский патриотический пост.