Одним из известнейших чудес, свершенных Ионой, считается прекращение моровой болезни в Новгородской земле, от которой умерло свыше 250 тысяч человек. Иона совершил крестный ход в Зверин монастырь, после чего моровая болезнь прекратилась.
В день Ионы на Руси издавна среди девиц существовал обычай привлечения женихов. Девицы молились Богу о хороших мужьях, а также выполняли особый обряд: на заре выходили во двор и разбрасывали мелкие монетки или небольшие вещицы, сделанные собственными руками, вокруг дома. Считалось, что это поможет привлечь будущих мужей.