Из-за своей близости к Золотому полумесяцу – основной зоне незаконного производства опия, которая охватывает части Афганистана, Пакистана и Ирана – Таджикистан является страной транзита и назначения для незаконного оборота наркотиков, особенно торговли героином. Вторым наиболее развитым рынком наркотиков в Таджикистане после рынка героина является рынок каннабиса; как и в случае с опиумом и героином, большая часть каннабиса переправляется через границу Таджикистана с Афганистаном.
Таджикистан имеет самую длинную границу с Афганистаном в Центральной Азии, протяженность которой составляет около 1400 километров. Большая часть этой границы проходит в труднодоступных горных районах, что чрезвычайно затрудняет защиту и делает Таджикистан уязвимым для незаконного оборота наркотиков, а также угроз и проблем, связанных с наркотиками. Благодаря этому Таджикистан является ключевым игроком в борьбе с незаконным оборотом наркотиков в Центральной Азии, особенно с учетом больших масштабов незаконного выращивания опийного мака в Афганистане и роста производства синтетических наркотиков в регионе. В 2020 году Таджикистан занял 11-е место в списке стран с крупнейшими изъятиями опиатов.
Первый государственный орган по контролю за наркотиками в независимом Таджикистане – Управление по борьбе с незаконным оборотом наркотиков Министерства внутренних дел – был создан в 1994 году. Через два года его сменила Государственная комиссия Республики Таджикистан по контролю за наркотиками.
27 апреля 1999 года Президент Таджикистана и заместитель Генерального секретаря ООН подписали протокол о создании органа по контролю за наркотиками, непосредственно подчиняющегося главе государства Таджикистана. Указом Президента Республики Таджикистан от 1 июня 1999 года Государственная комиссия по контролю за наркотиками была официально реорганизована в Агентство по контролю за наркотиками при Президенте Республики Таджикистан.
Агентство отвечает за реализацию государственной политики в сфере борьбы с незаконным оборотом наркотических средств. В его широкий круг обязанностей входит обеспечение соблюдения антинаркотического законодательства страны, предотвращение злоупотребления наркотиками и многое другое. Для выполнения своих задач Агентство работает в тесном сотрудничестве с Государственным комитетом национальной безопасности и другими соответствующими ведомствами, органами власти и организациями.
В 2006 году Таджикистан присоединился к недавно созданному Центральноазиатскому региональному информационно-координационному центру по борьбе с незаконным оборотом наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров (ЦАРИКЦ) — организации по борьбе с незаконным оборотом наркотиков, которая способствует сотрудничеству между органами по контролю за наркотиками Азербайджана, Казахстана, Кыргызстана, России, Таджикистана, Туркменистана и Узбекистана.
В 2022 году День работников государственных органов по борьбе за наркотиками был добавлен в список официальных праздников и памятных дат в Таджикистане. Как и все профессиональные праздники в стране, это рабочий день, если он не приходится на выходные дни.