Поскольку Филиппины расположены на архипелаге, береговая охрана играет важную роль в обеспечении безопасности страны. Филиппинская береговая охрана — одна из старейших организаций береговой охраны в Юго-Восточной Азии. Ее история восходит к военному правлению Соединенных Штатов на Филиппинах. Одним из первых шагов, которые предприняло временное военное правительство США, когда Испания уступила Филиппины Соединенным Штатам в 1898 году, было открытие порта Манилы и таможенных объектов.
17 октября 1901 года Филиппинская комиссия (законодательный орган с ограниченными исполнительными полномочиями, назначаемый президентом США) приняла закон о создании Бюро береговой охраны и транспорта при Министерстве торговли и полиции. Этот день считается днем рождения Филиппинской береговой охраны. Бюро курировало транспортную систему государственных служб и службу маяков. В 1905 году Бюро береговой охраны и транспорта было заменено Бюро навигации, которое было упразднено в 1913 году.
Возрождение филиппинской береговой охраны произошло после окончания Второй мировой войны, когда Филиппины получили независимость от США. Правительство Филиппин передало функции, обычно выполняемые береговой охраной, подразделению береговой охраны Филиппинского военно-морского патруля, предшественника ВМС Филиппин. В 1967 году береговая охрана Филиппин официально стала основным подразделением ВМС Филиппин.
Поскольку функции Филиппинской береговой охраны носили гражданский характер, она была отделена от ВМС Филиппин и передана из Министерства национальной обороны в Управление президента, а затем в Министерство транспорта и коммуникаций (ныне Министерство транспорта) в 1998 году. Однако во время войны береговая охрана Филиппин также подчиняется Министерству национальной обороны.
Преобразование береговой охраны в гражданскую службу позволило береговой охране получать помощь из других стран, что было бы гораздо сложнее для военного ведомства. Несмотря на то, что береговая охрана Филиппин является невоенной организацией, это вооруженная служба в форме. Он обеспечивает соблюдение законов в территориальных водах Филиппин, защищает жизнь и имущество на море, обеспечивает безопасность торговых судов, защищает морскую среду и ресурсы, а также проводит поисково-спасательные операции.
Филиппинская береговая охрана присутствует на всей территории Филиппинского архипелага. В ее состав входят тринадцать округов береговой охраны, 54 станции и более 190 подстанций по всей стране. В распоряжении береговой охраны имеются многоцелевые суда реагирования, поисково-спасательные суда, морские патрульные суда, патрульные катера, суда обеспечения (буйковые тендеры и буксиры) и небольшие катера, а также авиация (легкие самолеты, вертолеты и БПЛА).