На протяжении всей истории Молдовы основными цветами ее флага были синий и красный. Сине-красно-желтый триколор, похожий на триколор Румынии, впервые был использован недолговечной Молдавской Демократической Республикой, провозглашенной в декабре 1917 года и вошедшей в безоговорочный союз с Румынией.
В советское время флаг Молдавской ССР был похож на флаги других советских республик. Это было красное знамя с тонкой горизонтальной зеленой полосой посередине и золотыми серпом и молотом и красной звездой с золотой каймой в верхнем левом углу. По сей день это один из двух официальных флагов непризнанной Приднестровской Молдавской Республики.
Современный флаг Молдовы был разработан во времена Перестройки. Он был основан на румынском (валашском) триколоре, чтобы отразить национальную и культурную близость двух стран. Однако синяя полоса на молдавском флаге — берлинская синяя, тогда как синяя полоса на румынском флаге — кобальтово-синяя. В то же время оба флага используют одинаковые оттенки желтого и красного: хромово-желтый и ярко-красный.
Еще одно различие между двумя флагами заключается в том, что на флаге Молдовы изображен национальный герб. Трехцветный вариант флага был принят 27 апреля 1990 года; годовщина его принятия теперь отмечается как День государственного флага. Герб был добавлен к флагу 6 ноября 1990 года.
Итак, государственный флаг Молдовы состоит из трех вертикальных полос (синего, желтого и красного цвета). Средняя полоса дополнена национальным гербом. На гербе Молдовы изображен золотисто-коричневый орел, держащий оливковую ветвь в правой лапе, скипетр в левой лапе и православный крест в клюве. Подобный орел, только с мечом вместо оливковой ветви, присутствует на гербе Румынии.
На груди орла есть сине-красный щит с золотой головой зубра, между рогами которого расположена золотая восьмиконечная звезда. Справа от зубра изображена золотая геральдическая роза,а слева — золотой полумесяц. Голова зубра является символом независимости, гордости и силы молдавского народа; он был связан с Молдовой как минимум с XIV века.
До 2010 года флаг Молдавии был одним из двух национальных флагов, реверс которых отличался от лицевой стороны , а второй был флагом Парагвая. На оборотной стороне молдавского флага отсутствовал герб. Это изменилось после принятия нового закона о государственном флаге Молдовы 26 ноября 2010 года. С тех пор реверс флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.
В 2010 году парламент Молдовы официально учредил День государственного флага. Он отмечен церемониями поднятия флага и другими патриотическими мероприятиями и акциями, посвященными национальному флагу страны. Хотя День государственного флага является официальным праздником, он не является нерабочим днем, если только он не выпадает на субботу или воскресенье.