История системы здравоохранения Азербайджана началась в 1918 году, когда после распада Российской империи, а затем Закавказской демократической федеративной республики в июне 1918 года была образована Азербайджанская Демократическая Республика. Уже 17 июня Совет Министров АДР своим постановлением создал Министерство здравоохранения Азербайджана.
Первым министром здравия и призрения (так в АДР официально называлась должность министра здравоохранения и социального обеспечения) стал известный хирург Худадат-бек Рафибеков, который до того, как занять пост, не только работал по специальности, но и активно занимался культурно-просветительской деятельностью.
Рафибеков пробыл на посту чуть более полугода. С декабря 1918 года по март 1919 года министром здравоохранения АДР был Евсей Гиндес, с марта по декабрь 1919 года — Абрам Дастакян, а с декабря 1919 по апрель 1920 года — Муса-бек Рафиев. В 1920 году Азербайджанская Демократическая Республика прекратила свое существование, и ее министерство здравоохранения было преобразовано в народный комиссариат здравоохранения Азербайджанской ССР.
За время существования Министерства здравоохранения АДР (чуть меньше двух лет) в азербайджанских провинциях открыли более 30 больниц, штат каждой из которых состоял из одного терапевта, одного гинеколога, одной медсестры и двух фельдшеров. В 1920 году планировалось строительство 35 новых больниц и 56 фельдшерских пунктов, однако этим планам не суждено было сбыться из-за завоевания Азербайджана советскими войсками.
В советские времена День медицинского работника в Азербайджане отмечался в тот же день, что и в остальных республиках СССР, — третье воскресенье июня. После распада Советского Союза некоторые бывшие советские республики решили не изменять дату праздника. Сначала среди них был и Азербайджан, но в 2001 году Гейдар Алиев подписал указ о переносе Дня медицинского работника Азербайджана на 17 июня в честь учреждения первого Министерства здравоохранения страны.
Сегодня в Азербайджане функционируют около 750 больниц и 1670 поликлиник, в которых работают более 28 тысяч врачей и почти 56 тысяч средних медицинских работников (фельдшеров, медсестер, акушеров, лаборантов и т. п.). Подготовкой медицинского персонала в стране занимается Азербайджанский медицинский университет в Баку, ряд медицинских школ в разных городах страны, а также институт усовершенствования врачей и медицинская школа повышения квалификации и усовершенствования средних медицинских работников.
В День медицинского работника в медицинских учреждениях Азербайджана проводятся праздничные мероприятия — концерты, церемонии вручения наград, дипломов, грамот и ценных подарков. Но многим медицинским работникам приходится отмечать свой профессиональный праздник на работе, поэтому лучшим подарком для них станут искренние слова благодарности от пациентов и их родных.