Впервые правоохранительные органы появились в Киргизии в конце XIX века, когда она входила в состав Российской Империи. После Февральской революции 1917 года Временное правительство ликвидировало Департамент полиции и корпус жандармов, вместо них в уездах были созданы красногвардейские отряды, выполнявшие функции милиции.
14 октября 1924 года была сформирована Кара-Киргизская автономная область в составе РСФСР, а через две недели, 1 ноября, в области была официально образована милиция. В состав управления областной милиции вошли три подотдела: общая милиция, уголовный розыск и места заключения.
После распада СССР и провозглашения независимости Кыргызстана в стране были проведены несколько реформ МВД для того, чтобы усовершенствовать работу органов внутренних дел, повысить уровень доверия населения к милиции и усилить взаимодействие милиции с институтами гражданского общества. Текущая реформа была запущена в 2013 году.
В свой профессиональный праздник весь личный состав милиции Кыргызстана принимает поздравления от руководства, друзей и родных, а наиболее отличившиеся сотрудники получают ведомственные награды.