Республика Южный Судан считается одной из самых молодых в мире, она отделилась от Судана после продолжительной гражданской войны, начавшейся в конце ХХ века. История этой республики тесно связана с историей Судана.
Когда Африку начали колонизировать европейские страны, на территории нынешнего Южного Судана не было государственных образований в современном понимании. И только в 1820-1821 годах египетский режим Мухаммеда Али начал активную колонизацию данного региона.
Когда Судан был под контролем англо-египетских колониальных властей, Север и Юг страны управлялись отдельно, ведь Великобритания хотела максимально ограничить исламо-арабское влияние в Южном Судане. С этой целью в 1922 году даже был введен визовый режим для перемещения между Северным и Южным Суданом.
Но в 1956 году страна была объединена, столицей был объявлен город Хартум, а у власти закрепились политики с Севера, активно проводившие политику исламизации и арабизации населения Юга. Это привело к Первой гражданской войне, длившейся 17 лет.
В 1972 году было подписано Аддис-абебское соглашение, по которому Южный Судан получал определенное самоуправление. Но несмотря на это, в стране вскоре возобновилась политика исламизации, после того как пришедший к власти еще в 1969 году в результате военного переворота Джафар Нимейри провозгласил ислам приоритетным во всех сферах жизни.
В июне 1983 года началась вторая гражданская война в Судане, в которой суданские арабы воевали против неарабских народов юга страны. Арабскому правительству Судана в этой войне противостояла вооруженная группировка Народная армия освобождения Судана.
Война длилась 22 года и формально завершилась с подписанием Найвашского соглашения между Суданом и Народной армией освобождения Судана. Это соглашение предоставило Южному Судану автономию сроком на шесть лет. По истечении этого срока Южный Судан получал право на проведение референдума о независимости.
Найвашское соглашение не помогло полностью погасить конфликт, однако стало первым шагом на пути обретения Южным Суданом независимости. В 2008 году Южный Судан окончательно покинули войска Судана. А ровно через пять лет после подписания соглашения в регионе начался референдум по вопросу независимости от Судана, на котором почти 99 % проголосовавших высказались за отделение Южного Судана.