Андрес Бонифасио родился 30 ноября 1836 года. В 1892 году он познакомился с произведениями идеолога возрождения народов Юго-Восточной Азии Хосе Рисаля и вступил в основанную им Филиппинскую лигу.
Однако вскоре Рисаль был арестован, и лига фактически прекратила функционировать. Поэтому Бонифасио и другие представители революционно-демократического крыла лиги 7 июля 1892 года создали тайную патриотическую организацию Катипунан, целью которой была борьба с испанским владычеством.
В августе 1896 года Катипунан поднял восстание против колониальных властей, положившее начало Филиппинской революции. Некоторое время лидером революции был Бонифасио, но после ряда поражений его место занял генерал Эмилио Агинальдо. Поскольку Бонифасио отказался признавать его лидерство, Агинальдо отдал приказ о его аресте. 10 мая 1897 года Андрес Банифасио был казнен.
Сегодня Андреса Бонифасио считают национальным героем Филиппин, а его день рождения отмечается как национальный праздник, День Бонифасио.