До обретения независимости в 1991 году Азербайджан долгое время входил в состав СССР, а еще до этого — в состав Российской империи. В течение всего этого периода остро стояла проблема межэтнического конфликта азербайджанского и армянского народов, вылившаяся в результате в войну в Нагорном Карабахе.
В результате к лету 1993 года в Азербайджане политическая ситуация была близка к критической и в стране назревала реальная угроза гражданской войны: пришедший к власти в мае 1992 года Народный фронт (НФ) во главе с Абульфазом Эльчибеем, занявшим пост президента, оказался полностью неспособным управлять государством. Во избежание кровопролития Народный фронт пригласил в Баку Гейдара Алиева — выдающегося лидера Азербайджана.
Гейдар Алиев на то время жил в Нахичевани, ведь еще 3 сентября 1991 года он был избран председателем Верховного Совета Нахичеванской АССР. На этом посту он сумел добиться укрепления сотрудничества АР с Турцией, установил хорошие отношения с соседним Ираном, а также сумел ослабить напряженность на границе Армении и Нахичеванской АР в мае 1992 года.
Народный фронт пытался подчинить себе нахичеванский анклав, однако этого сделать не удалось. И попытка назначить министром внутренних дел ставленника Народного фронта Сиявуша Мустафаева в автономной республике провалилась. Сторонники НФ даже попытались захватить здание МВД и телецентр в Нахичевани, однако Алиев предъявил им ультиматум и нападавшие отказались от продолжения эскалации.
4 июня 1993 года в городе Гянджа вспыхнул мятеж, возглавленный полковником Суретом Гусейновым. Правительственная операция «Тайфун» по разоружению полковника и его приверженцев провалилась, некоторые высокопоставленные чиновники Азербайджана попали в плен, а Гусейнов требовал выдать ему орден на арест Эльчибея. Тогда Эльчибей лично пригласил Галиева в Баку для помощи в переговорах с мятежниками.
Поначалу посредничество Алиева не дало результата. Но 10 июня председатель Милли Меджлиса Исам Гамбар подал в отставку, а вместо него главой азербайджанского парламента стал 15 июня 1993 года Гейдар Алиев. Он за очень короткий срок сумел предотвратить назревающую гражданскую войну. День же его избрания Председателем Верховного Совета Азербайджана стал впоследствии праздничным.
Предложение сделать годовщину избрания Алиева главой Верховного Совета Азербайджана праздником было озвучено в 1997 году, а уже с 1998 года День национального спасения азербайджанского народа был официально включен в календарь азербайджанских государственных праздников.