После обретения Молдовой независимости от Советского Союза в стране начался процесс преобразования организаций и ведомств. Так, в сентябре 1991 году указом президента был упразднен Комитет государственной безопасности. Его функции были возложены на Министерство национальной безопасности (МНБ). 16 сентября того же года правительством была утверждена структура и основные функции МНБ, а 6 апреля 1992 года было принято Положение о Министерстве национальной безопасности.
Профессиональный праздник работников госбезопасности — День работников государственной безопасности Республики Молдова — был утвержден в 1997 году. Несмотря на то, что в 1999 году МНБ было упразднено, а вместо него роль главной разведывательной спецслужбы государства стала выполнять Служба информации и безопасности Республики Молдова (SIS), праздник не потерял своей значимости. Но изменения коснулись руководящего состава: если МНБ возглавлял министр национальной безопасности, являвшийся генералом армии, главой SIS является президент службы, который может быть и гражданским лицом.